Hydrokolonoterapii można poddać się bez jakiegoś specjalnego przygotowania. Dwa dni przed zabiegiem zaleca się spożywanie posiłków lekkostrawnych, zwłaszcza u osób z zaparciami w celu rozluźnienia i lepszego oczyszczenia jelita grubego. Nasze menu powinno zawierać kasze, owoce, warzywa i większą ilość wody niż zazwyczaj.

                                                                            

Natomiast unikamy smażonych potraw pochodzenia zwierzęcego, warzyw strączkowych itp. Dodatkowo można wypić napar z siemienia lnianego lub inne preparaty zawierające dużą ilość błonnika. Na początek zwykle zalecane są dwa, trzy zabiegi w zależności od stopnia zanieczyszczenia jelita grubego. Zalecana przerwa pomiędzy zabiegami to dwa do siedmiu dni,jelito jest wówczas odpowiednio nawilżone przed kolejnym płukaniem,co zwiększa efektywność dokładnego oczyszczenia.

Profilaktycznie dla zdrowia i dobrego samopoczucia zabiegi powtarzamy raz, dwa razy w roku.